1 引爆摩天楼
内容介绍
某日，经营医院的黑川宅主人黑川大造遭人殴打致，而这起案件也在（被柯南***的）小五郎的活跃之下顺利解决了。数日后，柯南收到著名建筑师森谷帝二寄给工藤新一的邀请函，于是柯南与作为代理人的小五郎一同出席。在那里，柯南得知了之前发生***的黑川宅是出自森谷的设计。
次日，存放在火药库的***被盗，而森谷所设计的建筑物也陆续被纵火焚毁。利用变声器给新一打电话，作出了犯罪的预告。为了阻止爆炸，柯南开始出动……
2 第十四个目标
内容介绍
正在慢跑的目暮警官遭人用十字弓射伤而住院了，而旁边发现了一把奇怪的刀。就在第二天，兰的母亲—妃英理吃了被人下毒的巧克力，昏倒在事务所里。紧接着阿笠博士也被歹徒用十字弓射伤……三人的名字内都有13、12、11的数字，且被害者都与小五郎有关系。到底这张***牌代表着什么？
柯南剧场版官方海报(17张)根据线索，目暮警官推断可能是……十年前，***牌的经营人村上丈，被当警察的小五郎逮捕。侦讯中，村上丈借口内急而挟持了来找小五郎的妃英理，企图逃走。枪法一流的小五郎第一枪掠过妃英理的腿部，然后再一枪击中村上丈，才结束了这场惊险的***。之后小五郎引咎辞职了，妃英理也和小五郎分了居。这件事对小兰的打击非常大。而村上丈在上个礼拜***释出狱了……
3 世纪末的魔术师
内容介绍
俄罗曼诺夫王朝的皇室秘宝——复活节之卵，将在大阪铃木财团美术馆内展出的同时，怪盗基德寄出犯案预告信准备夺取这无价的***艺术之宝，于是铃木会长要求小五郎协助警方侦查，以防彩蛋被窃取。柯南一行人来到大阪，遇到服部平次，便一同侦查此案。在美术馆遇到了俄罗斯大使馆的书记、珠宝美术商、罗马王朝研究家、职业摄影师等人。看完彩蛋，大家便解读预告信线索，不料将时间、地点都解读错误。而基德窃听到彩蛋被转移了，在疏于防备的情况下，基德成功地找到了回忆彩蛋。然而基德在逃离途中，却被神秘的杀手狙击，坠海失踪，生不明。柯南以新型滑板追踪，夺回彩蛋。与此同时从国外回来的香阪夏美**，从祖母的遗物中发现彩蛋的原稿图与实物不同。
柯南看了原稿后，认为彩蛋有两颗，而在彩蛋的玻璃上映照出夏美曾祖父所盖的城堡，所以大伙儿及对彩蛋虎视眈眈的研究者决议要去此城探索，找寻第二颗彩蛋。在返回东京的船上，摄影师寒川被杀，而且和基德相同是被击中右眼。目暮带着白鸟赶到，调查后柯南发现凶手可能是专门狙击右眼的职业杀手“史考兵”。而白鸟却几次揭穿柯南的提示，使小兰对柯南的身份起了怀疑……
4 瞳孔中的暗杀者
内容介绍
连续两位东京警视厅的现任刑事惨遭，而遇害的两位刑事都手握警察手册气绝身亡。这意味着什么？是对付警察的恐怖行为、或是过激派的暴行？警视厅正对此凶杀案件有关的人事物及警察组织内部着手进行搜查。而警视厅的内部秘密却如高墙般不可窥探！
柯南与小五郎前往警视厅向目暮警官、白鸟警官查询有关***的情报，但是友善的俩人却以此事不可告之而拒绝了。在小五郎努力追问下，却得到白鸟警官一句：“Need not to know〔无须知道〕……”这是警察之间所用的密语，也就是说***与警察内部有关！
小五郎、柯南和众多警察参加白鸟警官妹妹的婚宴，席间突然停电，兰和佐藤警官都在厕所中，正当兰拿起身旁的手电筒时枪声却响起，佐藤警官为保护兰而挨枪，听到枪声的小五郎等人涌入厕所时却已不着痕迹地脱逃了。这时，兰却因承受不了佐藤女警重伤昏迷的打击，从而患了逆性健忘！虽然记不起身边的事，但却可以照顾自己的日常生活。失去记忆的兰不断受到的攻击，为了找回记忆，众人带兰去多罗碧加乐园，却误认为找到真凶而放松警惕。此时，找出真凶的柯南赶往乐园保护兰……
5 通往天国的倒计时
详细内容
博士与少年***团一行人在露营的回家途中顺道参观一座位于西多摩市境内即将在近期完成的全日本最高的双塔摩天大楼。而这摩天大楼的拥有者同时也邀请了毛利父女和铃木园子前来参加开幕典礼，因而与柯南一行人偶然巧遇。
行人在秘书的带领之下参观了这座两栋长的一模一样的最尖端高科技双塔摩天大楼。但是，此时在这摩天大楼里却出现了多位与此建筑物有着不同关系的人士！不久之后第一个***发生了…。而且，令人不敢相信的是黑衣组织的成员竟然同时也在大楼附近出现，这让人不免联想到灰原哀自从那些日子以来，在深夜里究竟是在跟谁联络……？
柯南的真正身份会被那些家伙发现吗？且灰原哀究竟在给谁打电话？不管目暮警官等人如何的劝说，双塔摩天大楼的开幕典礼仍按照预定进行。为了查出这场发生在总楼层高300公尺的高科技摩天大楼的***真相，柯南将与其宿敌——也就是当初逼迫工藤新一喝下毒药使他身体缩小的凶手黑衣组织，展开一场史上最恐怖的攻防战…… ，而哀也相当活跃，凶手也令众人震惊不已，原因更是出乎别人意料，手法也是别具一格，Gin，Vodka等人也会出现，爆炸场面惊心动魄，可以说是剧场版的一个巅峰。
6 贝克街的亡灵
内容介绍
米花市政大楼正在举行能够一举改变全世界游戏业界价值观的模拟游戏“茧”的发表会。结合了最先进技术的“茧”，其游戏方式是先进入一部外型酷似蚕茧的大型胶囊，透过电脑的操作让游戏者沉睡于历史上曾经发生过***的时代，并进行挑战的虚拟体验游戏。柯南、兰、灰原以及少年***队的成员们也接获邀请，前往参加这场受到全世界瞩目的发表会，并阴错阳差的混入政界、财经界以及演艺界等代表人物的小孩群中，趁机乘上了“茧”。另一方面，“茧”的研发者兼负责人——坚村，竟然在发表会会场遭到。而在这起***发生的同时，一个自称“诺亚方舟”的人工智慧闯入“茧”的电脑系统，并切断身处虚拟世界的50名孩童所有能与外界连结的管道，对现实世界中所有的招待者宣布：“在这场解决历史***的游戏中，只要有一个人能够存活到最后就算你们赢。不过如果没有人能够存活到最后，参加游戏的所有人就会葬命于此。”一场失控的游戏开始了！
工藤新一的父亲，世界名推理作家─工藤优作也是这场发表会的特别来宾。优作负责监修“茧”游戏中的历史***，虽然能透过推理找出坚村遭到的原因，但关于柯南一行人，他只能在控制室看着他们的表现。柯南一行人必须在“茧”所设定重现的19世纪伦敦贝克街221号B，同时也是福尔摩斯留下无数传说之地，挑战一连串的考验。
一场结合虚拟实境与现实，用50条生命为赌注的游戏即将开始！
7 迷宫的十字路
详细内容
在东京某个位于西国立市的神社内，有三名可疑的男子正在密谈。突然有个戴着***面具的黑影男人出现，用日本刀和弓箭在瞬间将三人；与此***同时，大阪、京都也相继发生了***。警方在经过调查后发现，被的五人都是出没于东京、大阪、京都三地，专门偷窃著名佛像及艺术品的窃盗集团「源氏萤」的成员。这个集团以日本历史上最有名的悲剧武将——源义经的故事《义经记》为名，首脑化名「义经」，部下则以「弁庆」为首，各自以家将姓名相称。
另一方面，小五郎带着柯南、小兰和园子来到了京都。八年前，位于京都的古老寺院——山能寺中的一尊国宝级佛像遭到偷窃，寺院的住持委托他们解读一幅可以判断佛像藏匿地点的谜样的画像，因而请来了小五郎帮忙。柯南怀疑佛像是遭到窃盗集团「源氏萤」所窃，***开始向破解的方向进展。然而在他到达义经、弁庆的传说流传的历史遗迹——最著名的京都五条大桥调查时，有个手持竹刀的男人突然来袭！
瞬间躲过袭击的柯南，看到那名男子后感到十分惊奇。那个男子竟是与工藤新一并称的西部高中生***——服部平次，同时也是少数知道柯南就是工藤新一的人物之一。他也是为了追寻在大阪发生的窃盗集团成员被杀***的真相而到达京都，总是在较劲的柯南与平次，这次为了查出***的真相，决定联手进行调查，但是，两人万万没想到，戴着面具的黑影男人居然就出现在他们面前！在稠密的京都十字路口，隐藏于历史阴影的谜题及陷阱将袭击柯南一行人！难解的***、细腻的推理、友情、爱情以及主要角色全员到齐！而柯南的身体终于……
8 银翼的魔术师
详细内容
一个女人来到小五郎处，请其帮助看守宝石。这女人名叫牧树里，是代表着日本的女演员。她收到预告称有人将会去夺取她所拥有的宝石“命运的宝石”，而预告者正是怪盗基德。小五郎断言：基德将会在树里担任主角的传统话剧的公演最后一天前来盗宝。于是第二天，柯南，小五郎，兰还有少年***团一起前往传统话剧公演的东京汐留。柯南对小五郎的推理充满疑问，于是自己推理基德的出现。然而，在那里出现的竟是工藤新一！
当然，那个新一绝不是真的。但是，要证明那个新一是***的的话，就需要柯南表明自己的身份。基德似乎明白这一点，很大胆的想和小兰在一起。这时，在树里任主角的舞台上上演了《约瑟夫王妃》的一幕。被柯南看出真实身份的基德，如何盗走这蓝色的宝石呢！？然后，对柯南他们更大的考验是？
飞机上的危险一个接着一个，柯南他们究竟如何脱险？
9 水平线上的阴谋
详细内容
15年前的一个雾色浓稠的夜晚，在北大西洋的海上一艘正在航行中的货轮“第一八代丸”，撞上了前方巨大冰川发生事故沉没。万幸的是船上大部分人都逃过这一劫难，只有船长和一名船上的高级干部不幸罹难身亡。时间回到15年后的现在，地点是日本东京西多摩市的别墅密集区，八代财团旗下分属八代造成业的设计师八代英人，开车的时候心脏病突发，结果车子不幸掉下山崖造成车毁人亡。谁也没想到，时隔15年且分别发生在海洋和陆地上的两起事故，会是一项重大阴谋的开始。镜头转到正在太平洋上航行的豪华客轮阿芙洛迪特号上，这是根据希腊神话中的代表美丽的爱神阿芙洛迪特的名字命名的。柯南、小兰和毛利小五郎受到园子邀请，参加这首船的处女航。理所当然，这么受到瞩目的豪华客轮，参加处女航的都是些政界、社交界的绅士名媛。
然而没多久，船上出现了可疑分子，园子更遭到袭击被其监禁，***的是根据柯南的推理顺利找回了园子，正在众人欢欣鼓舞的时候，却发生了案件。被害者正是这次处女航的主办人，八代客轮的社长八代贵江，她是半个月以前***身亡的八代英人的妻子，紧接着八代财团的董事长，贵江的父亲八代延太郎也从船上神秘消失……
获悉此事的目暮警官带着一群警察上船来搜查，同时出动了东京海上保安厅的人对海上进行搜查，陆地上也有警视厅的人在八代英人出事的地点进行再搜查。与此同时，理所当然地我们的小主人公柯南也展开了他最擅长的推理。而这次包括乘客和船上工作人员，总共有600名嫌疑人。于是柯南、毛利小五郎以及警方分别展开了各自的调查，与此同时，也正展开他巨大的阴谋。
为了不影响乘客的情绪，船上的晚宴仍然如期举办。在柯南的努力下，真相即将被揭发时却突然发生了重大意外——游轮的机房发生了大爆炸！更在整艘游轮的主要机房内都安置了***，整个船身不停摇晃，让船员和乘客都惊恐万分，全船600条人命，就悬于疯狂的一念之间。
置身于无处可逃的大海上，引起了极大的恐慌和混乱，人们陷入了极度的不安中。更糟糕的是，这次连小兰也被卷入了危险里面——当然，本片的结果，依旧是正义战胜邪恶，柯南用他名***的推理救出了小兰，不过出人意料的是，这次掌握***关键的，却是新一和小兰超越了时间的羁绊。
10 ***们的镇魂歌
剧情大纲
小五郎和柯南一行人前往横滨。但是，却中了那名男子的圈套，兰和少年***团被做为人质。男子限时在10:00。该期间内若不能解开被委托的***的真相，兰等人便会被***炸成碎片。更令人吃惊的是，那名男子，居然知道柯南的真身就是工藤新一！
11 绀碧之棺
剧情大纲
故事本身的舞台发生在浮于那深蓝色的太平洋上的美丽岛屿“神海岛”（こうみじま）之上。传说自古以来在那岛屿之下的深海里安眠着古代遗迹“海底宫殿”而故事则由两位18世纪真实存在过的女海盗“Anne
Bonny”（16***～1720）“Mary
Read”（1690～1721）在那里所藏的宝藏而起。我们把视线转回现在，前往神海岛度***的柯南一行人，在岛上遇到了一群怪怪的业余寻宝探险爱好者。按照有少年***的地方必会发生命案的定律，在潜水探索海底宫殿时，探险团中的一位成员突然被鲨鱼围攻葬身于这太平洋的神秘之地。为了查明事实的真相，柯南与灰原哀展开了调查，寻宝案件以及海盗宝藏的传说成为剧情的明暗两线。
12 战栗的乐谱
详细内容
近日，发生了以音乐家为袭击目标的连续***，被害人均出身于原著名钢琴家领衔的一所音乐学院。柯南等一行人，受到了这位钢琴家的邀请，出席由他出资建造的音乐厅的落成典礼音乐会。音乐会的亮点是巴赫弹奏过的管风琴和世界著名的斯特拉迪瓦里琴的音色，以及拥有绝对音感的天才歌手的歌声。
可是，在音乐会正式举办前，陆续发生了许多可疑的***。
而在音乐会当天，柯南和女高音秋庭被袭,飘流在河流中,兰等人所在的音乐会场，突然发生了大爆炸。众人被包围在火海中，河中的柯南和秋庭唱出了准确的音调,顺利向警察求助,柯南等人在音乐会场外心急如焚,音乐会场内的所有人却因为音乐馆的隔音效果不知道任何危险的靠近……
室外，23根柱子被炸！
最后，进入了音乐会场的柯南找出了凶手，柯南和会场内的所有人命悬一线。千钧一发之际，灰原用元太的竖笛吹出：36664（MI LA
LA LA
FA），被柯南猜出是狙击（shoot)，佐藤从另一个地方开枪，凶手手中的遥控器掉落,被高木抓获。调音师说出了的理由，和钢琴家解除了误会。
等小兰他们要走时，发现柯南不见了。喷泉处传来一阵小提琴的声音，小兰听出是新一在演奏，便追了过去。结果却看到柯南拿着小提琴，说新一已经走了。故事在美丽的乐曲与月光下的兰和柯南中结束。
13 漆黑的追踪者
详细内容
故事的开始，柯南身份被Gin（琴酒）和Vodka(伏特加）识破并被擒住，小兰眼看就要遭遇毒手……原来是一场梦。
小五郎被请去参加警视厅召开的案件侦破会，发现里面的警察都是熟面孔……
警视厅的松本警视、静冈的横沟警部（哥哥），神奈川的横沟警部（弟弟），群马的山村警部、长野的大和警部，埼玉的荻野警部（是个有着危险气息的新人物）、京都的绫小路警部，长野的上原刑事。
当然还有永远都少不了的，东京的目暮警部、白鸟、佐藤、高木跟千叶。
需要侦破的案件是发生在东京以及周边省县的连续案，者们身份看不出什么共同点，但是他们后都被拿走了一件随身物品，却留了张***牌在。侦破会后，山村随口唱着《七つの子》（七个孩子），原因是在厕所里听到有人用手机按出了相似的声音，柯南震惊追出去一看，一人走进了黑色保时捷356A（琴酒的爱车）。
柯南从而确定侦破会的众多参与者当中，混有易容高手Vermouth（苦艾酒）。后在商厦追捕嫌疑犯时，柯南发现被作为人质劫持的人居然也是贝尔摩德***扮的，营救之后找她问事情原由。原来是被害者当中一人被拿走的物品当中，夹带着组织里的NOC名单(存在一张SD卡中)。
柯南看到Vermouth也得出结论，潜伏在警察当中的人是他人***扮，而被替换的人是谁呢？
而这时一个神秘的黑衣组织成员Irish，正在紧锣密鼓的调查柯南的身份，也得出“柯南=新一”的结论。（通过黑衣骑士面具上新一的指纹，跟美工课柯南捏的海豚上的指纹对比）
之后演出了一出黑衣组织阻拦警察去最后一个受害者家的狙击戏，当Chianti(基安蒂）的枪瞄准高木说了句“郎才”，而Korn（科恩）的枪瞄准佐藤说了句“女貌”，两人同时射击时，把车轱辘打爆了（延迟警察到现场的时间）。佐藤也感觉出那是狙击，跟高木说了，可是单纯的高木说她应该是多心了。佐藤还是怀疑警察队伍里混了奸细。
佐藤、高木在博士、小哀跟***队的联系之后，成功解救被调换、关押了10天的人物。
故事的最后柯南在服部、灰原的帮助下，推理出连续案凶手会出现在东京塔，赶去遇到凶手、又遇到***扮警察的Irish，对方已拿到卡片。
就在柯南遭遇危险时兰出现了，她想起新一说的话成功躲避了***，但因为被Irish半垂下来的面具吓到，最终被打倒了。柯南为了保护小兰引Irish来到东京塔顶，从他的话里得知自己身份已被拆穿，但是Irish不想杀他，而是要带柯南去见“那位大人”，以琴酒的重大过失来扳倒琴酒，因为琴酒轻易的就杀了那个Irish当做父亲般尊敬的pisco（匹斯克）。所以他并没有将柯南的真实身份说出去~~~就在他要擒住柯南的时候，Gin等人乘直升机赶来，求证Irish已经拿到名单。可是就在Irish拿出名单的SD卡，在琴酒要求下不断向前走之后，基安蒂开枪打穿了SD卡跟他的胸膛……
柯南想救Irish，这时Irish明白了Vermouth为何要掩护柯南，临前鼓励柯南。Gin抓狂了，开始用飞机上的30毫米机炮疯狂扫射，直升机的探照灯不停的照到躲避中的柯南，机枪一次次的从他身边扫过，但柯南仅仅只是左胳膊被玻璃碎片打中一下。而Gin还有飞机中的其他三人，居然都没有看到柯南。就在柯南被逼入绝境（真面目快给看到了）的时候，巧用博士的新发明（改进版的伸缩吊带，可伸缩100米……），不但脱险，还打中了Gin的飞机，使机尾着火最后坠毁（是把被机关枪射落的射灯，用伸缩吊带弹射出去，打中直升飞机尾部）。
众多警察赶到，营救成功！
看到飞机坠落、爆炸，骑着机车在周围转的Vermouth不禁露出笑容：“真不愧是银色***呀！”
后来柯南得到消息，直升机的残骸中没有任何人的遗体……
14 天空的遇难船
内容介绍
活跃于全世界，全天下的宝石怪盗基德，激起了大富豪铃木次郎吉与他对决的执着，因而对KID提出挑战书:具有“天空的贵妇人”美名之称的宝石就放在世界最大的飞行船「铃木号」中，能偷的话就来偷偷看，限制时间为东京到大阪6小时飞程。小五郎、兰以及少年***团也获邀次郎吉的招待搭乘此次飞行。能偷得到吗？能抓得到吗？就在以广阔的天空为舞台进行心理战的同时，神秘的***[冒用红色暹罗猫。]，袭击飞行船！到底挟劫的目的为何？KID与柯南间的对决又将会如何？兰也感染了细菌吗？KID和小兰真的如大家所想的那样接吻了吗？
15 沉默的15分钟
详细内容
仓朝都知事也受到了一封来路不明的恐吓信。并在第二天知事参加的京都线首航中在隧道里被所安置的***险些丧命。对此事怀疑不已的柯南等人便前往了于知事关系密切的北泽村参加冰雪节，并调查***。在此期间，她们偶遇了五位北泽村的旧村民。他们时隔八年的再见，却带来了一场灾难。第二天当众人由瑞树**的带领下徒步游览泽尻湖时，竟意外发现了五人中冰泽的尸体。一直因八年前事故昏迷的东马也突然醒来了。行动了... 他切断了全村的电话通号线，其次又在大坝上安装了***。柯南却在冰泽的衣服里找到了线索。同时步美等人正带着东马去八年前的现场，试图帮他恢复记忆，却不料险些被杀。幸好柯南和灰原及时赶到。大家躲进了山洞，并赶到大坝阻止五人中的凶手山尾炸毁大坝。而当他们赶到时，一切已晚。坝上的工作人员去参加庆典了，两个值班也早就被山尾的电击器击晕。而那边武藤被击晕。正在柯南疑惑之时，山尾却在他后面...到了大坝，山尾正打算解决他，被及时赶到的瑞树用击中。柯南用及时让他睡去。正当大家准备离开时，柯南突然发现刚刚瑞树和山尾纠缠的时候，竟启动了***！大家迅速的撤离了，而柯南却被困大坝。眼看洪水即将淹没小镇。柯南用滑到了小镇前面的滑雪场，制造雪崩，改变洪水的前进方向和力度。却也因此被埋没在雪堆中。众人拼劲全力，终于兰打通了新一的手机在第14分钟的时候唤醒了沉睡在雪里的柯南。柯南用足球告诉了大家他的方位，让他得以生还。
16 第11名前锋
剧情简介
毛利***事务所突然接到一通威胁电话。之后，路上的汽车就在小五郎的眼前爆炸了!“蓝色的少年与蓝色的斑马，从天而降的雨……”根据寄来的挑战书，若不能解读谜之暗号，便无法阻止接下来的爆炸。小五郎和毛利兰在米花市内来回奔走，却完全找不到破解暗号的方法。另一方面，此时的江户川 柯南与灰原和少年***团一起，沉浸在观看最爱的足球比赛的快乐之中。正当比赛渐入佳境之时，从兰打来的电话那里，柯南得知了威胁电话的事情。柯南为了解读暗号独自一人离开赛场，却得知了无人能够阻止的恐怖事实……
本片为日本J联赛创立20周年纪念作品，现役选手三浦知良、远藤保仁、今野泰幸、楢崎正刚、中村宪刚等人为片中本人的形象配音。
1.引爆摩天楼
某天，柯南在整理信件时，发现了一封寄给自己的信，原来是有名的建筑师－－森谷帝二邀请新一去参加他举办的茶会。没办法以新一身份去参加的柯南，打电话要小兰等人代替他去，但小兰开出另一个条件，要新一和她在5月3日晚上十点一起去看**。原来5月4日那天是自己的生日啊！柯南都把这件事给忘了。在茶会上小兰和森谷帝二谈起要和新一约会的事。
到了5月3日当天下午，小兰便出门了。柯南在无可奈何之际，看见新闻说火药库的火药被窃，而且最近发生了许多纵火***，似乎都出自同一人之手；而后这个打电话给新一，声称手里有***，要新一马上到堤向津川绿地公园，不然就会有人。柯南用划板迅速赶往公园，发现***团的孩子正在玩一架来由不明的轰炸机。虽然柯南击毁了飞机，但还是发生了爆炸。 这时罪犯又来电话，说3点在米花车站广场会有***爆炸，提示是在树下。柯南来到车站，发现原来***是放在一个装猫的宠物篮内，因为日语树根和猫同音，但篮子被人拿走了。柯南好不容易才追到篮子，可只剩20秒了，在倒数16秒这时记时器突然停了，但柯南刚把***带走一会儿就又开始跳动。柯南将***带离人群，但***还是爆炸了，他也受了伤，进了医院。
在医院里大家怀疑是新一的仇家干的，新一曾破的最有影响的案子是前西多摩市的冈本***开车撞人案，那个***因为此案而下台，西多摩市的市政建设***也因此而取消了……不久又来电话，声称在东京都环状线上装了5颗***，在下午4点后，行驶的列车速度不满60公里，或太阳下山了，那么就会爆炸，提示是***在“XX之X”，而***团的孩子也在车上。柯南从太阳能想到，***是在“铁轨之间”，但事后发现用去的***只是被偷的1/4。 白鸟警官发现几处被破坏的建筑都是森谷帝二30岁前设计的，大家来到森谷帝二家调查，柯南在他家的作品展览室发现了西多摩市的市镇建设***模型……没多久柯南就使露出了原形。
看似结束的***却尚未结束，说他已把最大的***放置在米花市政厅中了，而且……那不是小兰正处在的地方吗！此时离爆炸时间已所剩不多了……柯南尽全力来到大楼内，用电话联系小兰教她如何拆***。最后，只剩下两条电线，到底应该剪哪条呢？是剪有小兰和新一的***色的那条？……此时是5月4日零点！
2.第十四个目标
正在慢跑的目暮警官遭人用十字弓射伤而住院了，就在第二天，小兰的母亲—妃英理吃了被人下毒的巧克力，昏倒在事务所里，紧接着阿笠博士也被歹徒用十字弓射伤，每一个凶案现场都分别留下了有关黑桃***牌上K、Q、J上的物品，三人的名字内都有13、12、11的数字，且被害者都与小五郎有关系。到底这张***牌代表着什么？难道是亡……
根据线索，目暮警官推断可能是……十年前，***牌的经营人村上丈，被当警察的小五郎逮补。侦讯中，村上丈借口内急而挟持了来找小五郎的妃英理，企图逃走。枪法一流的小五郎第一枪掠过妃英理的腿部，然后再一枪击中村上丈，才结束了这场惊险的***。之后小五郎引咎辞职了，妃英理也和小五郎分了居。这件事对小兰的打击非常大，她从此对父亲失去了信心。而村上丈在上个礼拜***释出狱了……
怪异的连续袭击***是按照着***牌的顺序进行的，这一次出现的牌面是黑桃十。遭到狙击的是小五郎打高尔夫的球友辻弘树。柯南等搭乘辻弘树所驾驶的直升机，弘树驾驶前必要点的维他命被人给掉包了，眼睛遇太阳刺眼得张不开，失去了视力，所幸柯南及时降落，逃过了一劫而黑桃十出现在辻弘树家中。凶手的杀机笼罩着所有和小五郎有关的众人……
为了名字里有九的旭胜义，大家随泽木公平来到了著名的海上***中心乐乐广场。柯南发现了现场的人们名字中都含有「数字」。难道把所有的猎物都一网打尽吗？在海底餐厅里，他们并没有发现嫌犯--村上丈的踪影，却发现了主人旭胜义留下的纸条（其实是凶手留的）。在酒室中泽木公平遭袭。当大家回到餐厅时，却发现了实业家旭胜义的尸体。
被困在大厅里的众人纷纷找寻出口，刹那间灯熄了！名***儿小山内奈奈的手却发出了闪光，然后惨遭毒手，而在她的尸体旁边有一张黑桃七的***牌。此时巨大的爆炸声响起，炸毁的餐厅。大家逃离了海底，正当柯南指正凶手时，凶手捉了小兰当人质，并要柯南将***丢给他，一切的景象就跟小五郎当年面对村上挟持妃英理做人质一样……
3.世纪末的魔术师
柯南最强的对手－－“怪盗KID”再次登场，这次是窃取一颗罗曼诺夫王朝的皇室秘宝“回忆之蛋”。同时,小兰也开始怀疑柯南与新一的关系，名***——江户川柯南，终于要面对他生平最大的危机，也是史上最难解的谜团！透过彩蛋，可以看到俄国国王的全家福，很感人的画面。
4.瞳孔中的暗杀者
很有悬念的一部。剧中小兰身处案发现场，由于种种原因而失忆了。但是因为连续犯在开枪时，被小兰看到了他的模样，而小兰即遭到了随时被狙击的命运！同时这件案又有可能牵连警察内部，平时值得信任的刑警也被当作了嫌犯。为了唤起小兰的记忆最好的方法就是让他见到新一，但是……柯南又要如何化解这次的危机！究竟是谁？会是普通小喽喽，或是为居高阶级的警察官！？柯南即将面临史上又一次最大危机！！这次的***部分发生在新一变小的那个游乐场，这次柯南又要一显他特工般的滑板工夫了……
5.通往天国的倒计时
柯南一行人在露营的回家途中顺道参观一座位于西多摩市境内即将在近期完成的全日本最高双塔摩天大楼。而这摩天大楼的拥有者同时也邀请了小五郎与小兰前来参加开幕典礼，因而与柯南一行人偶然巧遇。
一行人在秘书的带领之下参观了这座两栋长的一模一样的最尖端高科技双塔摩天大楼。但是，此时在这摩天大楼里却出现了多位与此建筑物有着不同关系的人士！不久之后第一个***发生了…。而且，令人不敢相信的是《黑暗组织》的成员竟然同时也在大楼附近出现，这让人不免联想到灰原哀自从那些日子以来，在深夜里究竟是在跟谁联络……？
而柯南的真正身份会被那些家伙发现吗？且灰原哀真正的身份又是？不管目暮警官等人如何的劝说，双塔摩天大楼的开幕典礼仍按照预定进行。为了查出这场发生在总楼层高300公尺的高科技摩天大楼的***真相，柯南将与其宿敌——也就是当初逼迫工藤新一喝下毒药使他身体缩小的凶手——“黑衣组织”展开一场史上最恐怖的攻防战…… ，而哀也相当活跃，凶手也令众人震惊不已，原因更是出乎别人意料，手法也是别具一格，gin，沃克等人也会出现，爆炸场面惊心动魄.
6.贝克街的亡灵
东京·米花市·米花市政大楼，这里正在举行，能够一举改变全世界游戏业界价值观的模拟游戏「茧」的发表会。结合了最先进技术的「茧」，其游戏方式是先进入一部外型酷似蚕茧的大型胶囊，透过计算机的操作让游戏者沉睡于历史上曾经发生过***的时代，并进行挑战的虚拟体验游戏。柯南、小兰、灰原以及少年***队的成员们也接获邀请，前往参加这场受到全世界瞩目的发表会，并阴错阳差的混入政界、财经界以及演艺界等代表人物的小孩群中，趁机乘上了「茧」。另一方面，「茧」的研发者兼负责人—坚村，竟然在发表会会场遭到。而在这起***发生的同时，一个自称「诺亚方舟」的人工智能闯入「茧」的计算机系统，并切断身处虚拟世界的50名孩童所有能与外界连结的管道，对现实世界中所有的招待者宣布：「在这场解决历史***的游戏中，只要有一个人能够存活到最后就算你们赢。不过如果没有人能够存活到最后，参加游戏的所有人就会葬命于此。」开始了一场失控的游戏……
少数知道柯南身份，同时也是工藤新一的父亲，世界名推理作家—工藤优作也是这场发表会的特别来宾。优作负责监修「茧」游戏中的历史***，虽然能透过推理找出坚村遭到的原因，但关于柯南一行人，他只能在控制室看着他们的表现。柯南一行人必须在「茧」所设定重现的19世纪伦敦贝克街，同时也是福尔摩斯留下无数传说之地，挑战一连串的考验。一场结合虚拟实境与现实，用50条生命为赌注的游戏即将开始！
7.迷宫的十字路口
又是樱花漫舞的时节，整个剧场版充满浓重的日本传统气息。在历史古都京都连续发生多次案件，而这些案件多数建筑于历史背景之上。隐藏于历史暗影中的谜团和陷阱、远远超出想象的***向柯南和平次袭来！复杂交织的***相与埋在历史中的种种迷题，柯南点燃真相之光。棘手案件与推理、友情和恋情……还有柯南的身体终于……？！
在东京某个位于西国立市的神社内，有三名可疑的男子正在密谈。突然有个戴着***面具的黑影男人出现，用日本刀和弓箭在瞬间将三人；与此***同时，大阪、京都也相继发生了***。警方在经过调查后发现，被的五人都是出没于东京、大阪、京都三地，专门偷窃著名佛像及艺术品的窃盗集团「源氏萤」的成员。这个集团以日本历史上最有名的悲剧武将——源义经的故事《义经记》为名，首脑化名「义经」，部下则以「弁庆」为首，各自以家将姓名相称。
另一方面，小五郎带着柯南、小兰和园子来到了京都。八年前，位于京都的古老寺院——山能寺中的一尊国宝级佛像遭到偷窃，寺院的住持委托他们解读一幅可以判断佛像藏匿地点的谜样的画像，因而请来了小五郎帮忙。柯南怀疑佛像是遭到窃盗集团「源氏萤」所窃，***开始向破解的方向进展。然而在他到达义经、弁庆的传说流传的历史遗迹——最著名的京都五条大桥调查时，有个手持竹刀的男人突然来袭！
瞬间躲过袭击的柯南，看到那名男子后感到十分惊奇。那个男子竟是与工藤新一并称的西部高中生***——服部平次，同时也是少数知道柯南就是工藤新一的人物之一。他也是为了追寻在大阪发生的窃盗集团成员被杀***的真相而到达京都，总是在较劲的柯南与平次，这次为了查出***的真相，决定连手进行调查，但是，两人万万没想到，戴着面具的黑影男人居然就出现在他们面前！
在稠密的京都十字路口，隐藏于历史阴影的谜题及陷阱将袭击柯南一行人！难解的***、细腻的推理、友情、爱情以及主要角色全员到齐！而柯南的身体终于……
8.银翼的魔术师
演员牧树里所拥有的珠宝“命运的宝石”被锁定成为目标！预告函的署名是怪盗基德。但是，预告函为什么是送给工藤新一？基德会再次在柯南面前现身吗？惨剧的真相到底是什么？26个文字、滑道、怪盗基德，这一次的谜题是什么？关键又会是什么？
某天，毛利***事务所接到了知名舞台剧女演员牧树里的委讬。委讬内容是牧树里收到怪盗基德预告信，信中指出怪盗基德将在舞台上夺取牧树里佩带的星蓝宝石戒指——“命运的宝石”。
于是毛利小五郎接受保护宝石的工作，依据毛利小五郎的推理，基德将在演出的最后一天前来**这颗无价的宝石。在演出的最后一天，毛利小五郎、小兰和柯南受邀观赏舞台剧，在剧场里错综复杂的人群中，基德到底会***扮成谁出现在大家面前？在紧张的埋伏等候中，出现在大家面前的竟然是工藤新一！？
柯南一方面必须保护宝石，另一方面又不能拆穿基德***扮的工藤新一，因为拆穿基德就等于公开自己身体缩小的秘密。柯南只好盯紧***的工藤新一，一刻都不能松懈。就在舞台剧即将落幕之前，柯南发现***的工藤新一不见了，随即追上，但却在一片混乱之中来是让基德逃脱了。
不过，“命运的宝石”终究是保护住了，牧树里为了表示感谢，邀请毛利***前往北海道函馆的别墅度***，同行的还有一同演出的其他演员。就在大家都搭上飞机前往函馆的机舱里，一幕精心设计的剧码就在大家面前实际上演了。柯南除了要防止基德再度混入人群中，又要解开发生在飞机上的密室***，到底柯南要怎么行动？
9.水平线上的阴谋
除了故事本身的不同，第九部剧场版的制作相当出彩，由于故事的场景设定在一艘豪华游轮上，这就为画面的表现提供了很大的发挥空间，制作以后的效果也确实配得上这样的背景，甚至影片上映前就有宣传拿“泰坦尼克号”来相比了，虽说有些夸大，但未尝不是一个方面。实际比较柯南历次剧场版以后，可以发现本片的场面还算是比较的恢宏夺目，理应属于九部剧场版之中的上乘之制作。可以说这是一部仿效好莱坞**豪华场面的动画片，特别是结尾惊心动魄的场景设置，声画视听完全是一幅动作片的手法，那么不仅仅只局限于柯南迷们，所有喜欢动画片的观众，似乎都适合看一看这部**。当然，对于柯南迷们而言，本片应该没有让他们失望，但是也没有什么新鲜的味道，只是华丽场面的增加而已。PS：毛利小五郎这次可是有勇有谋、文武双全。
15年前的一个雾色浓稠的夜晚，在北大西洋的海上一艘正在航行中的货轮“第一八代丸”，撞上了前方巨大冰川发生事故沉没。万幸的是船上大部分人都逃过这一劫难，只有船长和一名船上的高级干部不幸罹难身亡。
时间回到15年后的现在，地点是日本东京西多摩市的别墅密集区，八代财团旗下分属八代造成业的设计师八代英人，开车的时候心脏病突发，结果车子不幸掉下山崖造成车毁人亡。谁也没想到，时隔15年且分别发生在海洋和陆地上的两起事故，会是一项重大阴谋的开始。
镜头转到正在太平洋上航行的豪华客轮阿芙萝蒂号上，这是根据希腊神话中的代表美丽的爱神阿芙萝蒂的名字命名的。柯南、小兰和毛利小五郎受到园子邀请，参加这首船的处女航。理所当然，这么受到瞩目的豪华客轮，参加处女航的都是些政界、社交界的绅士名媛。
然而没多久，船上出现了可疑分子，园子更遭到袭击被其监禁，***的是根据柯南的推理顺利找回了园子，正在众人欢欣鼓舞的时候，却发生了案件。被害者正是这次处女航的主办人，八代客轮的社长八代贵江，她是半个月以前***身亡的八代英人的妻子，紧接着八代财团的董事长，贵江的父亲八代延太郎也从船上神秘消失……
获悉此事的目暮警官带着一群警察上船来搜查，同时出动了东京海上保安厅的人对海上进行搜查，陆地上也有警视厅的人在八代英人出事的地点进行再搜查。与此同时，理所当然地我们的小主人公柯南也展开了他最擅长的推理。而这次包括乘客和船上工作人员，总共有600名嫌疑人。于是柯南、毛利小五郎以及警方分别展开了各自的调查，与此同时，也正展开他巨大的阴谋。
为了不影响乘客的情绪，船上的晚宴仍然如期举办。在柯南的努力下，真相即将被揭发时却突然发生了重大意外——油轮的机房发生了大爆炸！更在整艘油轮的主要机房内都安置了***，整个船身不停摇晃，让船员和乘客都惊恐万分，全船600条人命，就悬于疯狂的一念之间。
置身于无处可逃的大海上，引起了极大的恐慌和混乱，人们陷入了极度的不安中。更糟糕的是，这次连小兰也被卷入了危险里面——当然，本片的结果，依旧是正义战胜邪恶，柯南用他名***的推理救出了小兰，不过出人意料的是，这次掌握***关键的，却是新一和小兰超越了时间的羁绊。
10.***们的安魂曲（***们的镇魂歌）
接受谜样男子的委托，小五郎和柯南一行人前往横滨。但是，却中了那名男子的圈套，兰和少年***团被扣为人质。男子限时12小时。该期间内若不能解开被委托的***的真相，兰等人便会被***炸成碎片。更令人吃惊的是，那名男子，居然知道柯南的真身就是工藤新一！
11.绀碧之棺 （深蓝色的海盗旗）
在小五郎的带领下，柯南一行人前往位于太平洋上的小岛“神海岛”上享受愉快的***日，蔚蓝色的大海和无限的自然风光加上自古以来流传的两个“神海岛”传说让这个小岛成为游客成群的度***圣地。兰和园子在“海底宫殿”附近的海域享受有氧潜水，少年***团则玩起了神海岛观光课安排的寻宝游戏。然而，觑意于传说中的财宝的宝藏猎人们也潜入了这个迷人的小岛上。兰和园子意外的遭遇到一名被鲨鱼群袭击的宝藏猎人，猎人的是因为传说中的宝藏吗？急忙赶来的柯南发现了亡的疑点，并和灰原一起展开了调查。
“神海岛”流传这两个传说，一个是沉入海底的古代遗迹“海底宫殿”，它是沉入神秘岛海域的巨大岩石建筑群，虽然研究者纷至沓来，但始终没有人能解开“海底宫殿”的秘密，另一个传说是300年前活跃在加勒比海的2名女海盗“安妮·邦尼”和“玛莉·雷德”遗留下来的财宝，据说她们乘坐的海盗船遭到英国海军的攻击时，只有她们2人勇敢的战斗。随着调查的深入，迷一般的文字“Jolly Roger”浮出水面，宝藏的秘密近在眼前。然后要接近真相总要经历磨难，柯南他们找到的一部分财宝被谜一样的宝物猎人抢走了，而宝藏猎人的魔手也伸向了兰和园子，他们的目的究竟是什么？隐藏在传说中的真相是什么？隐藏在海底宫殿中的秘密又是什么？超越300年的暗号，柯南一一解明。
12.战栗的乐谱
近日，发生了以音乐家为袭击目标的连续***，被害人均出身于原著名钢琴家领衔的一所音乐学院。柯南等一行人，受到了这位钢琴家的邀请，出席由他出资建造的音乐厅的落成典礼音乐会。音乐会的亮点是巴赫弹奏过的管风琴和世界著名的斯特拉迪瓦里琴的音色，以及拥有绝对音感的天才歌手的歌声。
可是，在音乐会正式举办前，陆续发生了许多可疑的***。
而在音乐会当天，柯南和女高音秋庭被袭,飘流在河流中,兰等人所在的音乐会场，突然发生了大爆炸。众人被包围在火海中，河中的柯南和秋庭唱出了准确的音调,顺利向警察求助,柯南等人在音乐会场外心急如焚,音乐会场内的所有人却因为音乐馆的隔音效果不知道任何危险的靠近……
室外，23根柱子被炸！
最后，进入了音乐会场的柯南找出了凶手，柯南和会场内的所有人命悬一线。千钧一发之际，灰原用元太的竖笛吹出：32224，被柯南猜出是射击（shoot)，佐藤从另一个地方开枪，凶手手中的遥控器掉落,被高木抓获。调音师说出了的理由，和钢琴家解除了误会。
13 漆黑的追迹者
（预定于2009年4月18日上映）
一如以往，柯南果然继续有剧场版。并且，这一次的内容说的是有关黑衣组织的。
2008年4月上映的《名***柯南：战栗的乐谱》以音乐为题材创造新的***，并拿下上映当周的票房冠军。而现在，在其DVD尚未发售的今天，Bandai竟早早公开了剧场版新作，这比前作又早了一个月。
这次的新作全名为《名***柯南：漆黑的追迹者》（名探侦コナン 漆黒の追迹者），与前作一样予定于2009年4月上映。新作中出现在柯南面前的强敌就是当年灌他吃毒药以至他变成小孩子的神秘黑衣男琴酒，这次，此两名宿敌的再次对抗将成为新作的一大看点。此外，这也是黑衣男自第5作《通向天国的倒计时》之后第二次在剧场版登场。
“不能让他逃走，他很适合在这一天。”
动画部分，「第13弹制作决定!!」从两侧跑出来，占满整个银幕...（音效为撞击声）
其中「名***柯南」字样被黑色泥巴覆盖（背景音为主角们的吵杂对话）
而琴酒说完「不能让他逃走，他很适合在这一天」后，柯南字样随即被一双黑手掌盖住……
《名***柯南》从19***年上映首部剧场版《引爆摩天楼》以来，到今年为止一共推出了12部作品，《漆黑的追迹者》是系列第13作。每年都定于4月上映的该系列素来以高素质著称，是年度日本动画票房TOP10的常客。
经历了计时器、魔法、摩天楼、海底宝藏、音乐等题材，又拉上了服部、怪盗基德的人气配角做帮手，这次终于还是要再次动用琴酒大哥了……虽然被鱼肉的fans们也鸡翅有“剧场版真是一代不如一代”的感叹，进而质疑是否制作方真的是江郎才尽……但是，就算再怎么不满，看柯南新剧场版已然成为了动漫饭们的一大习惯，话说有爱才有希望，就让我们怀着一颗期盼之心，拭目以待《漆黑的追迹者》给我们带来这漫长等待下长长的享受……
剧情预告
剧场版搬出了久违的[黑暗组织]，上一次出现是第5部《天国的倒计时》。今次的故事剧情主要讲述以东京为中心，发生了6件大范围的连续***。并且每个者临前都说了一句：“七夕，节日……”随后就去。除了目暮警官、其他各县的刑警们，还有小五郎都参加了搜查会议。在机缘巧合之下，柯南偶然发现从会议场溜出的一位刑警乘上了一辆跑车。柯南瞬间愕然，“那辆车…。难道，是琴的!!”这毫无疑问是[黑暗组织]中的一人乔装打扮进入会议场地，然后乘坐琴的跑车逃走。连续***的凶手毫无疑问是[黑暗组织]的人。故事在此刻一触即发!如果工藤新一还活着的事被琴知道了，不仅是新一，和他有关联的柯南和其朋友们也会被抹杀掉。知道事情的极度严重性后，柯南开始了单独搜查。
这个，你其实可以去百度里搜的。
《引爆摩天楼》：某日，经营医院的黑川宅主人黑川大造遭人殴打致，而这起案件也在（被柯南***的）小五郎的活跃之下顺利解决了。数日后，柯南收到著名建筑师森谷帝二寄给工藤新一的邀请函，于是柯南与作为代理人的小五郎一同出席。在那里，柯南得知了之前发生***的黑川宅是出自森谷的设计。 次日，存放在火药库的***被盗，而森谷所设计的建筑物也陆续被纵火焚毁。利用变声器给新一打电话，作出了犯罪的预告。为了阻止爆炸，柯南开始出动……
《第十四个目标》：正在慢跑的目暮警官遭人用十字弓射伤而住院了，而旁边发现了一把奇怪的刀。就在第二天，小兰的母亲—妃英理吃了被人下毒的巧克力，昏倒在事务所里。紧接着阿笠博士也被歹徒用十字弓射伤……三人的名字内都有13、12、11的数字，且被害者都与小五郎有关系。到底这张***牌代表着什么？
柯南剧场版官方海报(17张) 根据线索，目暮警官推断可能是……十年前，***牌的经营人村上丈，被当警察的小五郎逮捕。侦讯中，村上丈借口内急而挟持了来找小五郎的妃英理，企图逃走。枪法一流的小五郎第一枪掠过妃英理的腿部，然后再一枪击中村上丈，才结束了这场惊险的***。之后小五郎引咎辞职了，妃英理也和小五郎分了居。这件事对小兰的打击非常大，她从此对父亲失去了信心。而村上丈在上个礼拜***释出狱了……
《世纪末的魔术师》：俄罗曼诺夫王朝的皇室秘宝——复活节之卵，将在大阪铃木财团美术馆内展出的同时，怪盗基德寄出犯案预告信准备夺取这无价的***艺术之宝，于是铃木会长要求小五郎协助警方侦查，以防彩蛋被窃取。柯南一行人来到大阪，遇到服部平次，便一同侦查此案。在美术馆遇到了俄罗斯大使馆的书记、珠宝美术商、罗马王朝研究家、职业摄影师等人。看完彩蛋，大家便解读预告信线索，不料将时间、地点都解读错误。而基德窃听到彩蛋被转移了，在疏于防备的情况下，基德成功地找到了回忆彩蛋。然而基德在逃离途中，却被神秘的杀手狙击，坠海失踪，生不明。柯南以新型滑板追踪，夺回彩蛋。与此同时从国外回来的香阪夏美**，从祖母的遗物中发现彩蛋的原稿图与实物不同。 柯南看了原稿后，认为彩蛋有两颗，而在彩蛋的玻璃上映照出夏美曾祖父所盖的城堡，所以大伙儿及对彩蛋虎视眈眈的研究者决议要去此城探索，找寻第二颗彩蛋。在返回东京的船上，摄影师寒川被杀，而且和基德相同是被击中右眼。目暮带着白鸟赶到，调查后柯南发现凶手可能是专门狙击右眼的职业杀手“史考兵”。而白鸟却几次揭穿柯南的提示，使小兰对柯南的身份起了怀疑……
《瞳孔中的暗杀者》：连续两位东京警视厅的现任刑事惨遭，而遇害的两位刑事都手握警察手册气绝身亡。这意味着什么？是对付警察的恐怖行为、或是过激派的暴行？警视厅正对此凶杀案件有关的人事物及警察组织内部着手进行搜查。而警视厅的内部秘密却如高墙般不可窥探！ 柯南与小五郎前往警视厅向目暮警官、白鸟警官查询有关***的情报，但是友善的俩人却以此事不可告之而拒绝了。在小五郎努力追问下，却得到白鸟警官一句：“Need not to know〔无须知道〕……”这是警察之间所用的密语，也就是说***与警察内部有关！ 小五郎、柯南和众多警察参加白鸟警官妹妹的婚宴，席间突然停电，小兰和佐藤警官都在厕所中，正当小兰拿起身旁的手电筒时枪声却响起，佐藤警官为保护小兰而挨枪，听到枪声的小五郎等人涌入厕所时却已不着痕迹地脱逃了。这时，小兰却因承受不了佐藤女警重伤昏迷的打击，从而患了逆性健忘！虽然记不起身边的事，但却可以照顾自己的日常生活。失去记忆的兰不断受到的攻击，为了找回记忆，众人带兰去多罗碧加乐园，却误认为找到真凶而放松警惕。此时，找出真凶的柯南赶往乐园保护兰……
《通往天国的倒计时》：
博士与少年***团一行人在露营的回家途中顺道参观一座位于西多摩市境内即将在近期完成的全日本最高的双塔摩天大楼。而这摩天大楼的拥有者同时也邀请了毛利父女和铃木园子前来参加开幕典礼，因而与柯南一行人偶然巧遇。 行人在秘书的带领之下参观了这座两栋长的一模一样的最尖端高科技双塔摩天大楼。但是，此时在这摩天大楼里却出现了多位与此建筑物有着不同关系的人士！不久之后第一个***发生了…。而且，令人不敢相信的是黑衣组织的成员竟然同时也在大楼附近出现，这让人不免联想到灰原哀自从那些日子以来，在深夜里究竟是在跟谁联络……？ 柯南的真正身份会被那些家伙发现吗？且灰原哀究竟在给谁打电话？不管目暮警官等人如何的劝说，双塔摩天大楼的开幕典礼仍按照预定进行。为了查出这场发生在总楼层高300公尺的高科技摩天大楼的***真相，柯南将与其宿敌——也就是当初逼迫工藤新一喝下毒药使他身体缩小的凶手黑衣组织，展开一场史上最恐怖的攻防战…… ，而哀也相当活跃，凶手也令众人震惊不已，原因更是出乎别人意料，手法也是别具一格，Gin，Vodka等人也会出现，爆炸场面惊心动魄，可以说是剧场版的一个巅峰。
《贝克街的亡灵》： 米花市政大楼正在举行能够一举改变全世界游戏业界价值观的模拟游戏“茧”的发表会。结合了最先进技术的“茧”，其游戏方式是先进入一部外型酷似蚕茧的大型胶囊，透过电脑的操作让游戏者沉睡于历史上曾经发生过***的时代，并进行挑战的虚拟体验游戏。柯南、小兰、灰原以及少年***队的成员们也接获邀请，前往参加这场受到全世界瞩目的发表会，并阴错阳差的混入政界、财经界以及演艺界等代表人物的小孩群中，趁机乘上了“茧”。另一方面，“茧”的研发者兼负责人——坚村，竟然在发表会会场遭到。而在这起***发生的同时，一个自称“诺亚方舟”的人工智慧闯入“茧”的电脑系统，并切断身处虚拟世界的50名孩童所有能与外界连结的管道，对现实世界中所有的招待者宣布：“在这场解决历史***的游戏中，只要有一个人能够存活到最后就算你们赢。不过如果没有人能够存活到最后，参加游戏的所有人就会葬命于此。”一场失控的游戏开始了！ 工藤新一的父亲，世界名推理作家─工藤优作也是这场发表会的特别来宾。优作负责监修“茧”游戏中的历史***，虽然能透过推理找出坚村遭到的原因，但关于柯南一行人，他只能在控制室看着他们的表现。柯南一行人必须在“茧”所设定重现的19世纪伦敦贝克街221号B，同时也是福尔摩斯留下无数传说之地，挑战一连串的考验。 一场结合虚拟实境与现实，用50条生命为赌注的游戏即将开始！
《迷宫的十字路口》：在东京某个位于西国立市的神社内，有三名可疑的男子正在密谈。突然有个戴着***面具的黑影男人出现，用日本刀和弓箭在瞬间将三人；与此***同时，大阪、京都也相继发生了***。警方在经过调查后发现，被的五人都是出没于东京、大阪、京都三地，专门偷窃著名佛像及艺术品的窃盗集团「源氏萤」的成员。这个集团以日本历史上最有名的悲剧武将——源义经的故事《义经记》为名，首脑化名「义经」，部下则以「弁庆」为首，各自以家将姓名相称。 另一方面，小五郎带着柯南、小兰和园子来到了京都。八年前，位于京都的古老寺院——山能寺中的一尊国宝级佛像遭到偷窃，寺院的住持委托他们解读一幅可以判断佛像藏匿地点的谜样的画像，因而请来了小五郎帮忙。柯南怀疑佛像是遭到窃盗集团「源氏萤」所窃，***开始向破解的方向进展。然而在他到达义经、弁庆的传说流传的历史遗迹——最著名的京都五条大桥调查时，有个手持竹刀的男人突然来袭！ 瞬间躲过袭击的柯南，看到那名男子后感到十分惊奇。那个男子竟是与工藤新一并称的西部高中生***——服部平次，同时也是少数知道柯南就是工藤新一的人物之一。他也是为了追寻在大阪发生的窃盗集团成员被杀***的真相而到达京都，总是在较劲的柯南与平次，这次为了查出***的真相，决定联手进行调查，但是，两人万万没想到，戴着面具的黑影男人居然就出现在他们面前！ 在稠密的京都十字路口，隐藏于历史阴影的谜题及陷阱将袭击柯南一行人！难解的***、细腻的推理、友情、爱情以及主要角色全员到齐！而柯南的身体终于……
《编辑本段银翼的魔术师》：一个女人来到小五郎处，请其帮助看守宝石。这女人名叫牧树里，是代表着日本的女演员。她收到预告称有人将会去夺取她所拥有的宝石“命运的宝石”，而预告者正是怪盗基德。小五郎断言：基德将会在树里担任主角的传统话剧的公演最后一天前来盗宝。于是第二天，柯南，小五郎，小兰还有少年***团一起前往传统话剧公演的东京汐留。柯南对小五郎的推理充满疑问，于是自己推理基德的出现。然而，在那里出现的竟是工藤新一！ 当然，那个新一绝不是真的。但是，要证明那个新一是***的的话，就需要柯南表明自己的身份。基德似乎明白这一点，很大胆的想和小兰在一起。这时，在树里任主角的舞台上上演了《约瑟夫王妃》的一幕。被柯南看出真实身份的基德，如何盗走这蓝色的宝石呢！？然后，对柯南他们更大的考验是？ 飞机上的危险一个接着一个，柯南他们究竟如何脱险？
《水平线上的阴谋》：15年前的一个雾色浓稠的夜晚，在北大西洋的海上一艘正在航行中的货轮“第一八代丸”，撞上了前方巨大冰川发生事故沉没。万幸的是船上大部分人都逃过这一劫难，只有船长和一名船上的高级干部不幸罹难身亡。时间回到15年后的现在，地点是日本东京西多摩市的别墅密集区，八代财团旗下分属八代造成业的设计师八代英人，开车的时候心脏病突发，结果车子不幸掉下山崖造成车毁人亡。谁也没想到，时隔15年且分别发生在海洋和陆地上的两起事故，会是一项重大阴谋的开始。镜头转到正在太平洋上航行的豪华客轮阿芙洛迪特号上，这是根据希腊神话中的代表美丽的爱神阿芙洛迪特的名字命名的。柯南、小兰和毛利小五郎受到园子邀请，参加这首船的处女航。理所当然，这么受到瞩目的豪华客轮，参加处女航的都是些政界、社交界的绅士名媛。 然而没多久，船上出现了可疑分子，园子更遭到袭击被其监禁，***的是根据柯南的推理顺利找回了园子，正在众人欢欣鼓舞的时候，却发生了案件。被害者正是这次处女航的主办人，八代客轮的社长八代贵江，她是半个月以前***身亡的八代英人的妻子，紧接着八代财团的董事长，贵江的父亲八代延太郎也从船上神秘消失…… 获悉此事的目暮警官带着一群警察上船来搜查，同时出动了东京海上保安厅的人对海上进行搜查，陆地上也有警视厅的人在八代英人出事的地点进行再搜查。与此同时，理所当然地我们的小主人公柯南也展开了他最擅长的推理。而这次包括乘客和船上工作人员，总共有600名嫌疑人。于是柯南、毛利小五郎以及警方分别展开了各自的调查，与此同时，也正展开他巨大的阴谋。 为了不影响乘客的情绪，船上的晚宴仍然如期举办。在柯南的努力下，真相即将被揭发时却突然发生了重大意外——游轮的机房发生了大爆炸！更在整艘游轮的主要机房内都安置了***，整个船身不停摇晃，让船员和乘客都惊恐万分，全船600条人命，就悬于疯狂的一念之间。 置身于无处可逃的大海上，引起了极大的恐慌和混乱，人们陷入了极度的不安中。更糟糕的是，这次连小兰也被卷入了危险里面——当然，本片的结果，依旧是正义战胜邪恶，柯南用他名***的推理救出了小兰，不过出人意料的是，这次掌握***关键的，却是新一和小兰超越了时间的羁绊。
《***们的镇魂歌》：在神秘委托者的招待下，小五郎与柯南受邀来到横滨的一座巨大城堡，没想到却掉入黑影的神秘男子所设下的陷阱。小兰、灰原与少年***团，也因此成为人质。时间限制为12个小时，如果不在时间内解开男子所出的谜题，小兰他们身上的ID就会爆炸。 “你能了解失去心爱的人，是什么样的心情吗？工藤” 这名男子居然知道柯南其实就是工藤新一？！这名男子的真正身份，难道是…… 同时，关西的高中生***----服部平次青梅竹马的和叶也被抓走（因为手上有***而受到威胁，并非抓走）成为了人质，白马探也受到委托。这些***们将与柯南一同挑战谜题。但是，当柯南他们正努力调查敌人的真面目之时，同时却也面临着一连串的危机。而众人追查已久的怪盗基德，居然也在此刻现身！时间一分一秒地逼近着，当大家解开了所有的谜题时，却又出现了新的难题。
《绀碧之棺》：在小五郎的带领下，柯南一行人前往位于太平洋上的小岛“神海岛”上享受愉快的***日，蔚蓝色的大海和无限的自然风光加上自古以来流传的两个“神海岛”传说让这个小岛成为游客成群的度***圣地。兰和园子在“海底宫殿”附近的海域享受有氧潜水，少年***团则玩起了神海岛观光课安排的寻宝游戏。然而，觑意于传说中的财宝的宝藏猎人们也潜入了这个迷人的小岛上。兰和园子意外的遭遇到一名被鲨鱼群袭击的宝藏猎人，猎人的是因为传说中的宝藏吗？急忙赶来的柯南发现了亡的疑点，并和灰原一起展开了调查。 “神海岛”流传这两个传说，一个是沉入海底的古代遗迹“海底宫殿”，它是沉入神秘岛海域的巨大岩石建筑群，虽然研究者纷至沓来，但始终没有人能解开“海底宫殿”的秘密，另一个传说是300年前活跃在加勒比海的2名女海盗“安妮·邦尼”和“玛莉·雷德”遗留下来的财宝，据说她们乘坐的海盗船遭到英国海军的攻击时，只有她们2人勇敢的战斗。随着调查的深入，迷一般的文字“Jolly Roger”浮出水面，宝藏的秘密近在眼前。然后要接近真相总要经历磨难，柯南他们找到的一部分财宝被谜一样的宝物猎人抢走了，而宝藏猎人的魔手也伸向了兰和园子，他们的目的究竟是什么？隐藏在传说中的真相是什么？隐藏在海底宫殿中的秘密又是什么？超越300年的暗号，柯南一一解明。
《战栗的乐谱》： 近日，发生了以音乐家为袭击目标的连续***，被害人均出身于原著名钢琴家领衔的一所音乐学院。柯南等一行人，受到了这位钢琴家的邀请，出席由他出资建造的音乐厅的落成典礼音乐会。音乐会的亮点是巴赫弹奏过的管风琴和世界著名的斯特拉迪瓦里琴的音色，以及拥有绝对音感的天才歌手的歌声。 可是，在音乐会正式举办前，陆续发生了许多可疑的***。 而在音乐会当天，柯南和女高音秋庭被袭,飘流在河流中,兰等人所在的音乐会场，突然发生了大爆炸。众人被包围在火海中，河中的柯南和秋庭唱出了准确的音调,顺利向警察求助,柯南等人在音乐会场外心急如焚,音乐会场内的所有人却因为音乐馆的隔音效果不知道任何危险的靠近…… 室外，23根柱子被炸！ 最后，进入了音乐会场的柯南找出了凶手，柯南和会场内的所有人命悬一线。千钧一发之际，灰原用元太的竖笛吹出：36664（MI LA LA LA FA），被柯南猜出是狙击（shoot)，佐藤从另一个地方开枪，凶手手中的遥控器掉落,被高木抓获。调音师说出了的理由，和钢琴家解除了误会。 等小兰他们要走时，发现柯南不见了。喷泉处传来一阵小提琴的声音，小兰听出是新一在演奏，便追了过去。结果却看到柯南拿着小提琴，说新一已经走了。故事在美丽的乐曲与月光下的兰和柯南中结束。
《漆黑的追踪者》：故事的开始，柯南身份被Gin（琴酒）和Vodka(伏特加）识破并被擒住，小兰眼看就要遭遇毒手……原来是一场梦。 小五郎被请去参加警视厅召开的案件侦破会，发现里面的警察都是熟面孔…… 警视厅的松本警视、静冈的横沟警部（哥哥），神奈川的横沟警部（弟弟），群马的山村警部、长野的大和警部，埼玉的荻野警部（是个有着危险气息的新人物）、京都的绫小路警部，长野的上原刑事。 当然还有永远都少不了的，东京的目暮警部、白鸟、佐藤、高木跟千叶。 需要侦破的案件是发生在东京以及周边省县的连续案，者们身份看不出什么共同点，但是他们后都被拿走了一件随身物品，却留了张***牌在。侦破会后，山村随口唱着《七つの子》（七个孩子），原因是在厕所里听到有人用手机按出了相似的声音，柯南震惊追出去一看，一人走进了黑色保时捷356A（琴酒的爱车）。 柯南从而确定侦破会的众多参与者当中，混有易容高手Vermouth（苦艾酒）。后在商厦追捕嫌疑犯时，柯南发现被作为人质劫持的人居然也是贝尔摩德***扮的，营救之后找她问事情原由。原来是被害者当中一人被拿走的物品当中，夹带着组织里的NOC名单(存在一张SD卡中)。 柯南看到Vermouth也得出结论，潜伏在警察当中的人是他人***扮，而被替换的人是谁呢？ 而这时一个神秘的黑衣组织成员Irish，正在紧锣密鼓的调查柯南的身份，也得出“柯南=新一”的结论。（通过黑衣骑士面具上新一的指纹，跟美工课柯南捏的海豚上的指纹对比） 之后演出了一出黑衣组织阻拦警察去最后一个受害者家的狙击戏，当Chianti(基安蒂）的枪瞄准高木说了句“郎才”，而korn（科恩）的枪瞄准佐藤说了句“女貌”，两人同时射击时，把车轱辘打爆了（延迟警察到现场的时间）。佐藤也感觉出那是狙击，跟高木说了，可是单纯的高木说她应该是多心了。佐藤还是怀疑警察队伍里混了奸细。 佐藤、高木在博士、小哀跟***队的联系之后，成功解救被调换、关押了10天的人物。 故事的最后柯南在服部、灰原的帮助下，推理出连续案凶手会出现在东京塔，赶去遇到凶手、又遇到***扮警察的Irish，对方已拿到卡片。 就在柯南遭遇危险时小兰出现了，她想起新一说的话成功躲避了***，但因为被Irish半垂下来的面具吓到，最终被打倒了。柯南为了保护小兰引Irish来到东京塔顶，从他的话里得知自己身份已被拆穿，但是Irish不想杀他，而是要带柯南去见“那位大人”，以琴酒的重大过失来扳倒琴酒，因为琴酒轻易的就杀了那个Irish当做父亲般尊敬的pisco（匹斯克）。所以他并没有将柯南的真实身份说出去~~~就在他要擒住柯南的时候，Gin等人乘直升机赶来，求证Irish已经拿到名单。可是就在Irish拿出名单的SD卡，在琴酒要求下不断向前走之后，基安蒂开枪打穿了SD卡跟他的胸膛…… 柯南想救Irish，这时Irish明白了Vermouth为何要掩护柯南，临前鼓励柯南。Gin抓狂了，开始用飞机上的机关枪疯狂扫射，直升机的探照灯不停的照到躲避中的柯南，机枪一次次的从他身边扫过，但柯南仅仅只是左胳膊被玻璃碎片打中一下。而Gin还有飞机中的其他三人，居然都没有看到柯南。就在柯南被逼入绝境（真面目快给看到了）的时候，巧用博士的新发明（改进版的绳索吊带，可伸缩100米……），不但脱险，还打中了Gin的飞机，使机尾着火最后坠毁（是把被机关枪射落的射灯，用伸缩吊带弹射出去，打中直升飞机尾部）。 众多警察赶到，营救成功！ 看到飞机坠落、爆炸，骑着机车在周围转的Vermouth不禁露出笑容：“真不愧是银色***呀！” 后来柯南得到消息，直升机的残骸中没有任何人的遗体……
《编辑本段天空的遇难船》：活跃于全世界，全天下的宝石怪盗基德，激起了大富豪铃木次郎吉与他对决的执着，因而对基德提出挑战书:具有“天空的贵妇人”美名之称的宝石就放在世界最大的飞行船「铃木号」中，能偷的话就来偷偷看，限制时间为东京到大阪6小时飞程。小五郎、小兰以及少年***团也获邀次郎吉的招待搭乘此次飞行。能偷得到吗？能抓得到吗？就在以广阔的天空为舞台进行心理战的同时，神秘的***[冒用红色暹罗猫。]，袭击飞行船！到底挟劫的目的为何？基德与柯南间的对决又将会如何？小兰也感染了细菌吗？基德和小兰真的如大家所想的那样接吻了吗？
《沉默的15分钟》：仓朝都知事也受到了一封来路不明的恐吓信。并在第二天知事参加的京都线首航中在隧道里被所安置的***险些丧命。对此事怀疑不已的柯南等人便前往了于知事关系密切的北泽村参加冰雪节，并调查***。在此期间，她们偶遇了五位北泽村的旧村民。他们时隔八年的再见，却带来了一场灾难。第二天当众人由瑞树**的带领下徒步游览泽尻湖时，竟意外发现了五人中冰泽的尸体。一直因八年前事故昏迷的东马也突然醒来了。行动了... 他切断了全村的电话通号线，其次又在大坝上安装了***。柯南却在冰泽的衣服里找到了线索。同时步美等人正带着东马去八年前的现场，试图帮他恢复记忆，却不料险些被杀。幸好柯南和灰原及时赶到。大家躲进了山洞，并赶到大坝阻止五人中的凶手山尾炸毁大坝。而当他们赶到时，一切已晚。坝上的工作人员去参加庆典了，两个值班也早就被山尾的电击器击晕。而那边武藤被击晕。正在柯南疑惑之时，山尾却在他后面...到了大坝，山尾正打算解决他，被及时赶到的瑞树用击中。柯南用及时让他睡去。正当大家准备离开时，柯南突然发现刚刚瑞树和山尾纠缠的时候，竟启动了***！大家迅速的撤离了，而柯南却被困大坝。眼看洪水即将淹没小镇。柯南用滑到了小镇前面的滑雪场，制造雪崩，改变洪水的前进方向和力度。却也因此被埋没在雪堆中。众人拼劲全力，终于在第14分钟的时候唤醒了沉睡在雪里的柯南。他用足球告诉了大家他的方位，让他得以生还。
《第11名前锋》：地点：11月20日，东都体育场，少年***团与灰原和柯南一起兴致勃勃的看足球比赛。与此同时，毛利***事务所突然接到一通威胁电话（大规模爆炸的预告电话）。这并不是游戏，也不是虚张声势，之后，路上的汽车就在小五郎的眼前爆炸了！“蓝色的少年与蓝色的斑马，从天而降的雨……”根据寄来的挑战书，若不能解读谜之暗号，便无法阻止接下来的爆炸。小五郎和兰同目暮警官，在米花市内反复寻找，却完全找不到破解暗号的方法。无计可施的兰把事情告诉给了柯南，柯南为了解读暗号独自一人离开赛场，却得知了无人能够阻止的恐怖事实，虽然已经被逼到了绝望的边缘，但是柯南仍没有放弃解决案件的决心，最后在爆炸的风暴中逃走了。
名***柯南目录
TV
1996年
001 云霄飞车***
002 董事长千金诱拐***
003 偶像密室***
004 大都会暗号地图藏宝***
005 新干线大爆炸***
006 情人节***
007 每月一份礼物威胁***
008 美术馆***
009 天下第一夜祭***
010 足球选手恐吓***
*011 钢琴奏鸣曲「月光」***
012 步美被绑***
013 奇怪的寻人***
014 谜样的讯息狙击***
015 消失的尸体***
016 古董品收藏家***
017 百货公司挟持***
018 六月新娘***
019 电梯***
020 鬼屋***
021 电视台外景队***
022 豪华客轮连续***（上集）
023 豪华客轮连续***（下集）
024 丧失记忆的美少女***
025 真***人质绑票***
026 爱犬约翰***
027 小五郎同学会***（上集）
028 小五郎同学会***（下集）
029 计算机***
030 不在场证明***
031 电视台***
032 咖啡厅***
033 ***团生还***
034 山庄绷带怪人***（上集）
035 山庄绷带怪人***（下集）
036 星期一晚上七时三十分***
037 仙人掌花***
038 红火祭***
039 企业家千金***（上集）
040 企业家千金***（下集）
041 优胜锦旗被割***
042 卡拉OK歌厅***
19***年
043 江户川柯南被绑***
044 堀田三兄弟***
045 敷面膜***
046 雪山山庄***
047 健身俱乐部***
048 外交官***（上集）
049 外交官***（下集）
050 图书馆***
051 高尔夫练习场***
*052 雾传说***
053 神秘凶器***
054 电玩公司***
055 列车手法***
056 清洁车***
057 福尔摩斯˙诡异的***（上集）
058 福尔摩斯˙诡异的***（下集）
059 第一次购物***
060 插画画家***
061 幽灵船***（上集）
062 幽灵船***（下集）
063 大怪兽哥斯拉***
064 第三个指纹***
065 螃蟹和鲸鱼***
066 夜路***
067 舞台女演员***
068 黑夜的怪男爵***（***篇）
069 黑夜的怪男爵***（疑惑篇）
070 黑夜的怪男爵***（解决篇）
071 米花之狼***
072 三胞胎别墅***
073 少年***团遇难***
074 神阵内***
075 金融公司社长***
*076 柯南 vs 怪盗KID
077 富豪家族连续惨***（上集）
078 富豪家族连续惨***（下集）
079 银行抢匪***
080 流浪画家***
081 当红歌星***（上集）
082 当红歌星***（下集）
083 综合病院***
084 滑雪别墅***（上集）
085 滑雪别墅***（下集）
1998年
086 诱拐现场特定***
087 白鹤报恩***
088 德休拉别墅***（上集）
089 德休拉别墅***（下集）
090 花香***
091 强盗住院***
092 恐怖的登山***（上集）
093 恐怖的登山***（下集）
094 雪女传说***
095 小五郎约会***
*096 走头无路的名***！连续两大***
0*** 离别美酒***
098 名陶艺家***（上集）
099 名陶艺家***（下集）
100 初恋情人回忆***（上集）
101 初恋情人回忆***（下集）
102 古装演员***（上集）
103 古装演员***（下集）
104 窃盗集团别墅***（上集）
105 窃盗集团别墅***（下集）
106 新闻照片***
107 鷃鼠星人之谜***（上集）
108 鷃鼠星人之谜***（下集）
109 ***团大追击***
110 烹饪教室***（上集）
111 烹饪教室***（下集）
112 帝丹小学七大离奇***
113 白色海滩*** 特别篇
114 有氧潜水***（上集）
115 有氧潜水***（下集）
116 推理***家失踪***（上集）
117 推理***家失踪***（上集）
*118 浪花连续***
119 ***面超人***
120 蜜蜂鸡尾酒***
121 浴室密室***（上集）
122 浴室密室***（下集）
123 天气预报**诱拐***
124 神秘的狙击者***（上集）
125 神秘的狙击者***（下集）
126 旅行戏团***（上集）
127 旅行戏团***（下集）
128 黑暗组织10亿抢劫***
1999年
*129 来自黑暗组织的女子 大学教授***
130 竞技场无差别胁迫***（上集）
131 竞技场无差别胁迫***（下集）
132 魔术爱好者***（***篇）
133 魔术爱好者***（疑惑篇）
134 魔术爱好者***（解决篇）
135 消失的凶器搜索***
136 蓝色古堡搜索***（上集）
137 蓝色古堡搜索***（下集）
138 最终播映***（上集）
139 最终播映***（下集）
140 SOS！步美传达的讯息
141 结婚前夕密室***（上集）
142 结婚前夕密室***（下集）
143 疑惑的天体观测
144 上野出发的北斗星3号（上集）
145 上野出发的北斗星3号（下集）
146 本厅刑事的恋爱物语（上集）
147 本厅刑事的恋爱物语（上集）
148 地上电车紧急煞车***
149 游乐园高空弹跳***
150 汽车爆炸***的真相（上集）
151 汽车爆炸***的真相（下集）
152 神秘老人失踪***
153 园子的夏日海滩冒险物语（上集）
154 园子的夏日海滩冒险物语（下集）
155 水中的钥匙密室***
156 本厅刑事的恋爱物语2（上集）
157 本厅刑事的恋爱物语2（下集）
158 沉默的环状线
159 诡异的五重塔传说（上集）
160 诡异的五重塔传说（下集）
161 流过流水亭的杀机
*162 飞机空中密室！工藤新一的首次的办案
163 月亮、星星与太阳的秘密（上集）
164 月亮、星星与太阳的秘密（下集）
165 少年***队消失***
166 鸟取县蜘蛛公馆的怪事（***篇）
167 鸟取县蜘蛛公馆的怪事（疑惑篇）
168 鸟取县蜘蛛公馆的怪事（解决篇）
169 维纳斯之吻
170 黑暗之中的角（上集）
171 黑暗之中的角（下集）
172 复活的亡讯息（上集）
173 复活的亡讯息（下集）
2000年
174 二十年后的杀机 圣佛尼号连续***
175 被杀了四次的男人
176 与黑暗组织的再会（灰原篇）
177 与黑暗组织的再会（柯南篇）
178 与黑暗组织的再会（解决篇）
179 咖啡厅卡车突然撞入***
180 红色的杀机夜想曲（上集
181 红色的杀机夜想曲（下集）
182 第九个门大搜查
183 危险的处方笺
*184 诅咒面具的冷笑
185 被狙击的名***（上集）
186 被狙击的名***（下集）
187 在黑暗中传出的神秘枪声
188 危命的复活 洞窟内的***团
189 危命的复活 负伤之下的名***
190 危命的复活 第三个选择
191 危命的复活 黑衣骑士
192 危命的复活 新一回来了
193 危命的复活 约定的场所
194 别有***的八音盒（上集）
195 别有***的八音盒（下集）
196 看不见的凶器．小兰的初次推理
1*** 超级汽车陷阱（上集）
198 超级汽车陷阱（下集）
199 嫌疑犯˙毛利小五郎（上集）
200 嫌疑犯˙毛利小五郎（下集）
201 第10个乘客（上集）
202 第10个乘客（下集）
203 伊卡尔斯的黑色之翼（上集）
204 伊卡尔斯的黑色之翼（下集）
205 本厅刑事的恋爱物语3（上集）
206 本厅刑事的恋爱物语3（下集）
207 完美的名推理
*208 朝向迷宫的入口．巨神像之怒
209 龙神山坠落***
210 五彩传说的水底龙宫（上集）
211 五彩传说的水底龙宫（下集）
212 松茸、熊与***队（上集）
213 松茸、熊与***队（下集）
214 演讲厅神秘***
215 Bay of the Revenge（上集）
216 Bay of the Revenge（下集）
217 目暮尘封的秘密（上集）
218 目暮尘封的秘密（下集）
2001年
*219 名***的会集！新一vs怪盗KID
220 一直说谎的委托人（上集）
221 一直说谎的委托人（下集）
222 人鱼又再度哭泣（***篇）
223 人鱼又再度哭泣（推理篇）
224 人鱼又再度哭泣（解决篇）
225 买卖繁盛的秘密
226 格斗游戏的陷阱（上集）
227 格斗游戏的陷阱（下集）
228 潜藏杀机的陶艺教室（上集）
229 潜藏杀机的陶艺教室（下集）
230 诡密的乘客（上集）
231 诡密的乘客（下集）
232 公寓坠落***
233 无法消灭的证据（上集)
234 无法消灭的证据（下集）
235 寝室的酒窖
236 南纪白滨的神秘之旅（上集）
237 南纪白滨的神秘之旅（下集）
238 大阪3K***（上集）
239 大阪3K***（下集）
240 新干线护送***（上集）
241 新干线护送***（上集）
242 元太少年的灾难
243 毛利小五郎的冒充者（上集）
244 毛利小五郎的冒充者（下集）
245 向日葵馆的枪声
246 缠在网子中的谜团（上集）
247 缠在网子中的谜团（下集）
248 治愈之森的不在场称证明
249 偶像们的秘密（上集）
250 偶像们的秘密（下集）
251 OK牧场的悲剧
252 在图画里面的犯
253 本厅刑事的恋爱物语4（上集）
254 本厅刑事的恋爱物语4（下集）
255 松江玉造连句十四回合定胜负（上集）
256 松江玉造连句十四回合定胜负（下集）
257 非常奇怪的天谴 动画原创
258 来自芝加哥的男子（上集）
259 来自芝加哥的男子（下集）
260 摇动的餐馆
261 降雪之夜的恐怖传说（上集）
262 降雪之夜的恐怖传说（下集）
2002年
*263 大阪双谜 浪花剑士与太阁之城
264 法庭上的对决 妃VS小五郎 (上集)
265 法庭上的对决 妃VS小五郎 (下集)
266 情人节的真实（***篇）
267 情人节的真实（推理篇）
268 情人节的真实（解决篇）
269 犯罪的遗物 （上集）
270 犯罪的遗物 （下集）
271 急忙掩饰的忽略（上集）
272 急忙掩饰的忽略（下集）
273 提问婆婆失踪***
274 幽灵屋的真相（上集）
275 幽灵屋的真相（下集）
276 警察手册丢失***
277 英语教师VS西部名***（上集）
278 英语教师VS西部名***（下集）
279 迷宫的阴暗（上集）
280 迷宫的阴暗（下集）
281 小小的目击者
282 水流石庭的***（上集）
283 水流石庭的***（下集）
284 中华街 雨中的似曾相识（上集）
285 中华街 雨中的似曾相识（下集）
286 工藤新一纽约***（***篇）
287 工藤新一纽约***（推理篇）
288 工藤新一纽约***（解决篇）
289 迷惘森林中的光彦（上集）
290 迷惘森林中的光彦（下集）
291 孤岛的公主与龙宫城（***篇）
292 孤岛的公主与龙宫城（追求篇）
293 孤岛的公主与龙宫城（解决篇）
294 爱与决心的必杀球（上集）
295 爱与决心的必杀球（下集）
296 屋形船 震惊的钓鱼
2*** 法庭的对决II 妃VS九条（上集）
298 法庭的对决II 妃VS九条（下集）
299 友情与杀意的关门海峡（上集）
300 友情与杀意的关门海峡（下集）
301 恶意与胜者的行进（上集）
302 恶意与胜者的行进（下集）
303 能回来的受害者
2003年
*304 震动的警视厅！1200万人质
305 看不见的嫌疑犯（前篇）
306 看不见的嫌疑犯（后篇）
307 无声的证据（前篇）
308 无声的证据（后篇）
309 与黑暗组织的再会（交涉篇）
310 与黑暗组织的再会（追踪篇）
311 与黑暗组织的再会（决篇）
312 夕阳染红的女儿节人偶（前篇）
313 夕阳染红的女儿节人偶（后篇）
314 栏杆损坏的了望台
315 阳光普照的地方
316 玷污的***面英雄（前篇）
317 玷污的***面英雄（后篇）
318 ***的雪茄盒（前篇）
319 ***的雪茄盒（后篇）
320 不在场证明的隐身术
321 消失的逃逸车（前篇）
322 消失的逃逸车（后篇）
323 服部平次一筹莫展（前篇）
324 服部平次一筹莫展（后篇）
325 火焰中的红马（***篇）
326 火焰中的红马（搜索篇）
327 火焰中的红马（解决篇）
328 生日葡萄酒之谜
329 被挑拨的友情（前篇）
330 被挑拨的友情（后篇）
331 疑惑的咖喱饭（前篇）
332 疑惑的咖喱饭（后篇）
333 像公主的人（前篇）
334 像公主的人（后篇）
335 东京现影所的秘密（前篇）
336 东京现影所的秘密（前篇）
337 坠落***的隐情
338 四辆保时捷（前篇）
339 四辆保时捷（后篇）
340 厕所里隐藏的秘密（前篇）
341 厕所里隐藏的秘密（后篇）
*342 豪斯登堡的新娘
343 便利店的陷阱（前篇）
344 便利店的陷阱（后篇）
2004年
*345 直面黑色组织的对决!满月之夜的二元神秘***
346 寻找P股上的印记（前篇）
347 寻找P股上的印记（后篇）
348 爱、幽灵和地球遗产（前篇）
349 爱、幽灵和地球遗产（后篇）
350 被遗忘的手机（前篇）
351 被遗忘的手机（后篇）
352 钓鱼大会的悲剧（前篇）
353 钓鱼大会的悲剧（后篇）
354 小小的委托者（前篇）
355 小小的委托者（后篇）
*356 怪盗基德的惊异的空中步行
357 恋人是春天的幻觉
358 本厅刑事恋爱故事5（前篇）
359 本厅刑事恋爱故事5（后篇）
360 不可思议的春天甲壳虫
361 帝丹高中的学校怪谈（前篇）
362 帝丹高中的学校怪谈（后篇）
363 都市的乌鸦
364 共时***件（前篇）
365 共时***件（后篇）
366 可遇见的码头惨剧（前篇）
367 可遇见的码头惨剧（后篇）
368 魔女栖息的糖果之家
369 好运男子的历险
370 四处辗转的游戏软件
371 沉没的航线（前篇）
372 沉没的航线（后篇）
373 巨毒蜘蛛的陷阱
374 星星和香烟的暗号（前篇）
375 星星和香烟的暗号（后篇）
376 限时15时
377 桃太郎解密之旅（前篇）
378 桃太郎解密之旅（后篇）
379 深山温泉、雪中之夜和年轻女子***(前篇)
380 深山温泉、雪中之夜和年轻女子***(后篇)
381 谁的推理秀(前篇)
382 谁的推理秀(后篇)
*383 甲子园的奇迹 绝不能输给看不见的恶魔
2005年
384 目标毛利小五郎
385 斯特拉迪瓦里小提琴的不和谐音(前奏曲)
386 斯特拉迪瓦里小提琴的不和谐音(间奏曲)
387 斯特拉迪瓦里小提琴的不和谐音(尾奏曲)
388 醉在萨摩的小五郎（前篇）
389 醉在萨摩的小五郎（后篇）
390 本厅的刑事恋物语6(前篇)
391 本厅的刑事恋物语6(后篇)
392 谜样的身长相差20厘米
393 似乎是的***
394 怪屋大冒险(封印篇)
395 怪屋大冒险(操纵篇)
396 怪屋大冒险(解决篇)
3*** 辛辣苦口却又甘甜的汤
398 奇妙一家的委托(前篇)
399 奇妙一家的委托(后篇)
400 持有疑惑的小兰
401 宝石抢匪现行犯(前篇)
402 宝石抢匪现行犯(后篇)
403 不可思议的天使之馆(前篇)
404 不可思议的天使之馆(后篇)
405 呼叫救护车的男子
406 柯南和平次的推理魔术(装置篇)
407 柯南和平次的推理魔术(公馆篇)
408 柯南和平次的推理魔术(解决篇)
409 同时进行的舞台和(前篇)
410 同时进行的舞台和(后篇)
411 神社鸟居之惊悚暗号(前篇)
412 神社鸟居之惊悚暗号(后篇)
413 完全一半犯罪之谜
414 追逐兰色小鸟的少年***团
415 佛灭前出现的恶灵（***篇）
416 佛灭前出现的恶灵（推理篇）
417 佛灭前出现的恶灵（解决篇）
418 米花町阁楼之家
419 八头蛇的剑(前篇)
420 八头蛇的剑(后篇)
421 银杏色的初恋(前篇)
422 银杏色的初恋(后篇)
423 ***团和青虫四兄弟
424 来自小丑的邮件
2006年
*425 Black impact ! 被组织的魔掌触碰的瞬间
426 给兰的情书
427 超秘密的上学路(前篇)
428 超秘密的上学路(后篇)
429 无法归来的二人(前篇)
430 无法归来的二人(后篇)
431 本厅刑事恋物语7(前篇)
432 本厅刑事恋物语7(后篇)
433 柯南 奇怪的孩子
434 名犬cool的功劳
435 聚焦***团的取材（前篇）
436 聚焦***团的取材（后篇）
437上户彩和新一 4年前的约定
438 鱼邮件的追踪
439 然后，谁都不在了
440 极限飞车
441 临终的啊啊
442 被钢铁构架阻挡的男子
443 叹气赶海（前篇）/2006.6.26
444 叹气赶海（后篇）/2006.7.03
445 俄罗斯蓝猫的秘密/2006.7.10
446 封印的欧式窗（前篇）/2006.7.24
447 封印的欧式窗（后篇）/2006.7.31
448 目黑的秋刀鱼***
*449 本厅的刑事恋爱物语 伪装的婚礼 1小时特别篇
450 圈套VS魔术（前篇）
451 圈套VS魔术（后篇）
* 452 金比罗座的怪人 1小时特别篇
剧场版
1：记时引爆摩天楼
2：第十四个的目标
3：世纪末的魔术师
4：瞳孔中的暗杀者
5：通往天国的倒计时
6：贝克街的亡灵
7：迷宫的十字路口
8：银翅膀的魔术师
9：水平线上的阴谋
10: ***们的阵魂歌
OVA
1：柯南 vs Kid vs Yaiba 宝刀争夺大作战!
2：16个嫌疑犯
3：柯南、平次与消失的少年
4：基德与水晶之母
5：目标是小五郎!!少年***团的秘密调查。
6：追踪消失的钻石！柯南&平次vsKID！
TV特别版
特别篇01-钢琴奏鸣曲"月光"***
特别篇02-雾传说***
特别篇03-柯南对怪盗基德
特别篇04-走头无路的名***！连续两大***
特别篇05-浪花连续***
特别篇06-来自黑暗组织的女子！大学教授***
特别篇07-飞行中的密室！工藤新一首次***
特别篇08-第二十年的杀机！圣佛尼号连续***
特别篇09-诅咒***面的冷笑
特别篇10-朝向迷宫的入口！巨神像之怒
特别篇11-名***的会集！新一vs怪盗KID
特别篇12-大阪双谜！浪花剑士与太阁之城
特别篇13-震动的警视厅！1200万人质
特别篇14-豪斯登堡的新娘
特别篇15-直面黑色组织的对决!满月之夜的二元神秘***
特别篇16-怪盗基德的惊异的空中步行
特别篇17-甲子园的奇迹 绝不能输给看不见的恶魔
特别篇18-Black impact ! 被组织的魔掌触碰的瞬间
特辑
1：彷徨的红蝴蝶
2：飞上天空的十颗行星
3：少年***团7分钟特辑
4：追寻迷一样的水星怪兽
5：青山刚昌短篇集
6：银翼的时间之旅
7：水平线上的柯南小五郎
